En parcourant la réserve du Bout du lac depuis les rives jusqu’à l’intérieur des terres, on rencontre les milieux suivants : des roselières aquatiques et terrestres, des landes à saule cendré et des taillis d'aulnes, des bois de chêne pédonculé, des prairies agricoles plus ou moins humides, et une forêt galerie présente le long des cours d'eau qui traversent le site, l’Ire et l’Eau Morte,
Deux espèces végétales emblématiques sont recensées : la gentiane pneumonanthe et le liparis de Loesel. La faune piscicole (brochets, perches, tanches...) côtoie les passereaux caractéristiques de ces milieux (rousserolles, locustelles...). Les oiseaux hivernants (fuligules milouins ou morillons...) passent la mauvaise saison dans de bonnes conditions au cœur de la réserve.
Le marais de Giez entre dans la catégorie des marais alcalins, c’est-à-dire des zones humides situées en partie basse d'un réseau d'eau plutôt calcaire. Il comprend une végétation typique à base de laîche, de choin et d’orchidées remarquables telles que le Liparis de Loesel. En matière de faune, on peut y rencontrer le castor d’Europe, les couleuvres à collier et d'esculape et de nombreux oiseaux tels le martin-pêcheur, le harle bièvre, le milan noir, ou les rousserolles effarvatte et verderolle.
