Depuis 1984, la ville de Saint-Cyr-sur-Mer est gestionnaire de la partie terrestre du site. En 2009, elle le devient aussi sur une partie du Domaine Public Maritime qui a été attribué au Conservatoire du littoral au droit de la calanque de Port d'Alon et de la baie de la Moutte.
Ses principaux objectifs sont :
- la préservation des espèces : suivis faune/flore, plantations, découverte du milieu marin dans la Calanque de Port d’Alon ;
- l’entretien des paysages par le maintien de zones agricoles : réhabilitation du Domaine viticole de la Nartette, installation du « Conservatoire du Mourvèdre » destiné à maintenir la diversité du patrimoine génétique du cépage « Bandol », culture des oliviers ;
- la protection du site contre l’impact d’une forte fréquentation : requalification écologique et paysagère de Port d’Alon, protection de la coulée de sable menacée par la surfréquentation ;
- la valorisation du patrimoine agricole et industriel : sentier des vignes, patrimoine bâti militaire et industriel restauré par des chantiers de bénévoles, projet pédagogique à destination des scolaires de la commune ;
- l'accueil et la sensibilisation des plus jeunes : accueil des scolaires, animations autour de la thématique apicole...