Le site du Fort Carré bénéficie d'un écosystème riche, varié et protégé. Il fait partie du réseau Natura 2000 « « Baie et Cap d’Antibes – Iles de Lérins ». Il est également classé en ZNIEFF.
Faune
La faune présente sur le site du Fort Carré comporte des espèces qui trouvent en ces lieux un habitat propice : rossignols, tourterelles, hérissons, écureuils, renards roux. Les reptiles sont également représentés avec plusieurs variétés de lézards et de couleuvres.
Flore
La flore du Fort Carré comporte des habitats d’intérêt communautaire pour Natura 2000 :
- végétation annuelle des laisses de mer dont la formation est essentiellement ponctuelle.
- falaises avec une végétation des côtes méditerranéennes de Limonium spp. Endémique.
- formations basses d’Euphorbes près des falaises. Cet habitat correspond à des garrigues littorales représentées par des arbrisseaux bas ainsi que par l’Euphorbe épineuse. Il représente une grande valeur.
- parcours substeppiques de graminées et annuelles du Thero-Brachypodietea.
Ce sont des pelouses annuelles riches en espèces annuelles et en particulier en espèces protégées.
- forêts à Olea et Ceratonia, typiques de l’étage thermo-méditerranéen et se caractérisant par l’Olivier et le Caroubier.