Le bois du Boucanet et les berges nord de l'étang du Ponant rassemblent aujourd’hui 28 habitats naturels différents, accueillant de nombreuses espèces rares et menacées. Ces habitats peuvent être répartis en plusieurs grands types de végétation tels que les prés salés (32%), les dunes (31%), les sansouires et salicornaies (5%), les steppes salées (5%), ...
D'un point de vue floristique, 19 espèces d'intérêt patrimonial dont 6 protégées ont été recensées : l’Orcanette des sables (Onosma arenaria), la Spiranthe d’été (Spiranthes aestivalis), le Plantain de Cornut (Plantago cornuti), l’Orchis parfumé (Orchis coriophora), ...
D'un point de vue faunistique, deux espèces phares occupent le devant de la scène et présentent un enjeu majeur pour la conservation de la biodiversité : le Pélobate cultripède (Pelobates cultripes), une espèce d'amphibien très rare en région méditerranéenne et le lézard ocellé (Timon lepidus) dont les populations sont extrêmement rares et en très forte régression sur le littoral du Languedoc Roussillon. Les causes de forte régression des populations de ces deux espèces sont la destruction, la pollution et/ou de la disparition de leur habitat naturel (milieux dunaires et mares temporaires).