D’importantes études floristiques sont menées dès le début des années 1990 grâce au soutien financier de l’Europe. Concernant les milieux secs, les habitats de la dune grise sont les plus remarquables : on y note la présence de la violette de Curtis. Mais ce sont les zones humides qui révèlent les espèces les plus originales. Le liparis de Loesel est présent dans les pannes humides tandis que la plaine intradunaire conserve des habitats tourbeux ou para-tourbeux exceptionnels avec la présence du cirse anglais, du choin noirâtre et de la linaigrette à feuille étroite.
Les amphibiens (tritons et grenouilles) sont bien représentés en termes de diversité spécifique ainsi que les odonates (libellules). Du fait de l’arrêt de la chasse au gibier d’eau sur ce site, le cortège d’oiseaux est aujourd’hui marqué par une présence renforcée des oiseaux d’eaux. Lieu de pause et de repli pour eux, les dunes de Berck participent au réseau des haltes migratoires recommandé par la Directive Oiseaux. On peut y découvrir aigrettes, spatules, sarcelles, marouettes. Les zones boisées sont favorables à la présence de la bondrée apivore et accueillent régulièrement la cigogne noire.