Habitats et flore
Au sein de la plaine alluviale du Fangu, l’embouchure renferme un complexe de zones humides et de zones sèches d’un intérêt écologique et paysager exceptionnel. A ce titre, l’embouchure bénéficie d’un certain nombre de protections et fait partie intégrante de la Réserve Man &
Réserve de biosphère de la vallée du Fangu
https://www.facebook.com/ReserveDeBiosphereDeLaValleeDuFango
et du site d’importance communautaire « Rivière et Vallée du Fango ».
Au cœur de l’embouchure, le fleuve fait naître une diversité d’habitats naturels liés à la permanence de l’eau et constitue un vecteur de dissémination d’espèces végétales et animales qui vivent d’ordinaire plus en altitude. La végétation du delta est ainsi une mosaïque contrastée. Autour, elle exprime la sécheresse : cistaie du lit à sec en amont du delta ; chênaie verte remarquable du cordon littoral, longtemps menacée par le camping sauvage pratiqué sur ce site ; maquis dense à lentisque, arbousier et calycotome sur les flancs de la vallée. Le cœur est un tout autre monde. Dans le marais tourbeux, ombragé et peu accessible, règnent ormes et aulnes séculaires, fougères osmonde, laîches aux feuilles tranchantes, nombril de venus. Au sein de ce boisement hygrophile remarquable, un système potamique (plan d'eau à écoulement lent) s’étire au milieu d’un véritable chaos arboré. Dans les eaux douces et claires des bras morts, les nymphéas blancs constituent un écrin pour la tortue Cistude.
La faune
A la mesure de la diversité des habitats qui constituent le site, la faune hébergée à l’embouchure du Fangu est diversifiée. Une population importante de tortues d’eau (Cistude) est présente dans les bras de la rivière.
Avec seulement 4 espèces d’oiseaux d’eau nicheurs, l’embouchure peut être considérée comme une zone humide marginale sur le plan ornithologique. Mais la mosaïque de biotopes permet néanmoins d’abriter une avifaune très variée à l’échelle de la Corse. On trouve à la fois des oiseaux d’eau et des oiseaux forestiers ou du maquis, et on relève en tout une quarantaine d’espèces d’oiseaux nicheuses. C’est aussi un site d’hivernage important pour les passereaux.
Une espèce exotique envahissante, l'écrevisse de Louisiane, a colonisé le site ces dernières années. Des études et suivis sont réalisés pour tenter de contrôler cette infestation, évaluer ses effets sur les écosystèmes et éviter que cette espèce ne se répande dans d'autres sites naturels de Corse.